Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms