Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccnd1P25322 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms