Protein–RNA interactions for Protein: P23819

Gria2, Glutamate receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria2P23819 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gria2P23819 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gria2P23819 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gria2P23819 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gria2P23819 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gria2P23819 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gria2P23819 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gria2P23819 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gria2P23819 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gria2P23819 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gria2P23819 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gria2P23819 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gria2P23819 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gria2P23819 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gria2P23819 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gria2P23819 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gria2P23819 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria2P23819 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria2P23819 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms