Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfyaP23708 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfyaP23708 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfyaP23708 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfyaP23708 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NfyaP23708 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfyaP23708 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfyaP23708 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfyaP23708 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms