Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcb1aP21447 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcb1aP21447 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcb1aP21447 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcb1aP21447 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcb1aP21447 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcb1aP21447 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcb1aP21447 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcb1aP21447 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcb1aP21447 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcb1aP21447 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcb1aP21447 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcb1aP21447 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms