Protein–RNA interactions for Protein: P21278

Gna11, Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gna11P21278 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Gna11P21278 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gna11P21278 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gna11P21278 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gna11P21278 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gna11P21278 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gna11P21278 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gna11P21278 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gna11P21278 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gna11P21278 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms