Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TP20293 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TP20293 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TP20293 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TP20293 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TP20293 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TP20293 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TP20293 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TP20293 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TP20293 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TP20293 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TP20293 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TP20293 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TP20293 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP20293 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP20293 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP20293 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP20293 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TP20293 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP20293 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP20293 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP20293 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP20293 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP20293 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP20293 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP20293 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP20293 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP20293 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP20293 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP20293 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TP20293 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TP20293 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TP20293 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TP20293 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TP20293 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TP20293 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TP20293 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TP20293 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TP20293 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TP20293 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TP20293 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TP20293 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TP20293 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TP20293 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP20293 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP20293 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP20293 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP20293 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP20293 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP20293 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP20293 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP20293 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP20293 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TP20293 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP20293 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP20293 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP20293 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP20293 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP20293 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TP20293 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP20293 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP20293 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP20293 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP20293 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP20293 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP20293 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP20293 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP20293 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP20293 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP20293 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP20293 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP20293 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP20293 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP20293 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TP20293 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TP20293 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TP20293 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TP20293 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TP20293 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TP20293 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TP20293 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TP20293 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TP20293 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TP20293 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TP20293 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TP20293 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TP20293 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TP20293 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
TP20293 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TP20293 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP20293 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP20293 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP20293 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP20293 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP20293 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP20293 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP20293 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP20293 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TP20293 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP20293 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms