Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms