Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms