Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps6ka3P18654 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps6ka3P18654 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps6ka3P18654 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps6ka3P18654 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps6ka3P18654 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps6ka3P18654 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps6ka3P18654 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps6ka3P18654 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps6ka3P18654 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps6ka3P18654 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps6ka3P18654 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps6ka3P18654 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps6ka3P18654 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps6ka3P18654 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps6ka3P18654 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps6ka3P18654 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps6ka3P18654 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps6ka3P18654 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps6ka3P18654 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps6ka3P18654 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps6ka3P18654 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps6ka3P18654 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps6ka3P18654 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps6ka3P18654 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms