Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18526 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18526 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18526 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18526 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18526 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18526 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18526 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18526 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18526 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18526 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P18526 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18526 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18526 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18526 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18526 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18526 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18526 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18526 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P18526 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18526 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18526 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18526 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18526 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18526 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18526 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18526 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18526 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18526 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18526 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18526 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18526 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18526 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18526 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18526 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18526 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18526 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18526 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P18526 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18526 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P18526 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18526 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18526 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18526 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18526 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18526 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18526 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18526 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18526 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18526 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18526 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18526 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18526 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P18526 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18526 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P18526 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18526 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18526 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18526 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18526 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18526 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18526 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18526 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18526 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18526 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18526 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18526 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18526 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18526 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P18526 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18526 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18526 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18526 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18526 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18526 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18526 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18526 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P18526 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18526 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18526 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18526 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18526 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18526 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18526 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P18526 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P18526 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18526 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18526 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18526 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18526 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18526 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18526 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18526 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P18526 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18526 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18526 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18526 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18526 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18526 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18526 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms