Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtpraP18052 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtpraP18052 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtpraP18052 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtpraP18052 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtpraP18052 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtpraP18052 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms