Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Hoxb1P17919 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Hoxb1P17919 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Hoxb1P17919 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Hoxb1P17919 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Hoxb1P17919 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Hoxb1P17919 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Hoxb1P17919 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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