Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pou4f1P17208 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Pou4f1P17208 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou4f1P17208 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms