Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme1P15532 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme1P15532 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme1P15532 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme1P15532 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme1P15532 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme1P15532 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme1P15532 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme1P15532 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms