Protein–RNA interactions for Protein: P15375

Myf6, Myogenic factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf6P15375 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myf6P15375 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myf6P15375 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myf6P15375 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myf6P15375 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Myf6P15375 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Myf6P15375 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Myf6P15375 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Myf6P15375 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myf6P15375 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myf6P15375 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myf6P15375 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myf6P15375 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myf6P15375 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myf6P15375 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myf6P15375 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Myf6P15375 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myf6P15375 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myf6P15375 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms