Protein–RNA interactions for Protein: P12849

Prkar1b, cAMP-dependent protein kinase type I-beta regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkar1bP12849 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkar1bP12849 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkar1bP12849 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkar1bP12849 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkar1bP12849 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms