Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Calb1P12658 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Calb1P12658 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Calb1P12658 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Calb1P12658 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Calb1P12658 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Calb1P12658 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Calb1P12658 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Calb1P12658 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Calb1P12658 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Calb1P12658 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms