Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga5P11688 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga5P11688 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga5P11688 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga5P11688 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga5P11688 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itga5P11688 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga5P11688 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga5P11688 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga5P11688 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga5P11688 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga5P11688 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga5P11688 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga5P11688 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga5P11688 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga5P11688 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga5P11688 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga5P11688 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga5P11688 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga5P11688 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga5P11688 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga5P11688 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga5P11688 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itga5P11688 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga5P11688 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga5P11688 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga5P11688 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga5P11688 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga5P11688 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga5P11688 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga5P11688 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga5P11688 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga5P11688 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga5P11688 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga5P11688 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga5P11688 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga5P11688 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga5P11688 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga5P11688 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga5P11688 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga5P11688 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga5P11688 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms