Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DmdP11531 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DmdP11531 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DmdP11531 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DmdP11531 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DmdP11531 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DmdP11531 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DmdP11531 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DmdP11531 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DmdP11531 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DmdP11531 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DmdP11531 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DmdP11531 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DmdP11531 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DmdP11531 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DmdP11531 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DmdP11531 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DmdP11531 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DmdP11531 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DmdP11531 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DmdP11531 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DmdP11531 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DmdP11531 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DmdP11531 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DmdP11531 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DmdP11531 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DmdP11531 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DmdP11531 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DmdP11531 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DmdP11531 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DmdP11531 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DmdP11531 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DmdP11531 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DmdP11531 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DmdP11531 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DmdP11531 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
DmdP11531 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DmdP11531 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DmdP11531 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DmdP11531 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DmdP11531 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DmdP11531 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DmdP11531 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DmdP11531 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DmdP11531 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DmdP11531 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DmdP11531 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DmdP11531 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DmdP11531 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DmdP11531 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DmdP11531 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DmdP11531 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DmdP11531 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DmdP11531 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DmdP11531 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DmdP11531 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DmdP11531 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DmdP11531 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DmdP11531 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DmdP11531 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DmdP11531 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DmdP11531 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DmdP11531 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DmdP11531 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DmdP11531 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DmdP11531 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DmdP11531 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DmdP11531 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DmdP11531 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DmdP11531 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DmdP11531 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DmdP11531 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DmdP11531 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DmdP11531 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DmdP11531 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DmdP11531 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DmdP11531 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DmdP11531 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DmdP11531 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DmdP11531 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DmdP11531 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DmdP11531 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DmdP11531 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DmdP11531 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DmdP11531 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DmdP11531 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DmdP11531 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DmdP11531 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DmdP11531 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DmdP11531 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DmdP11531 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DmdP11531 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DmdP11531 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DmdP11531 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DmdP11531 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DmdP11531 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DmdP11531 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DmdP11531 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DmdP11531 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DmdP11531 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms