Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb4P10284 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms