Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CatspereP0DP43 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms