Protein–RNA interactions for Protein: P0DP27

Calm2, Calmodulin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm2P0DP27 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Calm2P0DP27 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Calm2P0DP27 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calm2P0DP27 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calm2P0DP27 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calm2P0DP27 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calm2P0DP27 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Calm2P0DP27 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Calm2P0DP27 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Calm2P0DP27 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Calm2P0DP27 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Calm2P0DP27 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Calm2P0DP27 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calm2P0DP27 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calm2P0DP27 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calm2P0DP27 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calm2P0DP27 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calm2P0DP27 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calm2P0DP27 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calm2P0DP27 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calm2P0DP27 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calm2P0DP27 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calm2P0DP27 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calm2P0DP27 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calm2P0DP27 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calm2P0DP27 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calm2P0DP27 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calm2P0DP27 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calm2P0DP27 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calm2P0DP27 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calm2P0DP27 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calm2P0DP27 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calm2P0DP27 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calm2P0DP27 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calm2P0DP27 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calm2P0DP27 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calm2P0DP27 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Calm2P0DP27 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calm2P0DP27 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calm2P0DP27 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms