Protein–RNA interactions for Protein: P0DN89

Tmem254a, Transmembrane protein 254, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254aP0DN89 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Tmem254aP0DN89 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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