Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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