Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms