Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms