Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms