Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifna9P09235 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifna9P09235 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifna9P09235 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifna9P09235 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifna9P09235 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifna9P09235 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifna9P09235 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifna9P09235 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna9P09235 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna9P09235 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna9P09235 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna9P09235 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna9P09235 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna9P09235 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna9P09235 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna9P09235 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna9P09235 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna9P09235 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna9P09235 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna9P09235 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna9P09235 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifna9P09235 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifna9P09235 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifna9P09235 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifna9P09235 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifna9P09235 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifna9P09235 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifna9P09235 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifna9P09235 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifna9P09235 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifna9P09235 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.1 ms