Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb5P09079 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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