Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxb7P09024 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxb7P09024 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxb7P09024 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxb7P09024 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxb7P09024 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxb7P09024 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxb7P09024 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxb7P09024 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxb7P09024 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxb7P09024 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hoxb7P09024 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms