Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NefmP08553 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NefmP08553 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NefmP08553 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NefmP08553 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NefmP08553 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NefmP08553 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NefmP08553 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NefmP08553 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NefmP08553 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NefmP08553 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NefmP08553 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NefmP08553 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NefmP08553 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NefmP08553 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NefmP08553 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NefmP08553 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NefmP08553 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NefmP08553 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NefmP08553 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NefmP08553 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NefmP08553 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NefmP08553 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NefmP08553 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NefmP08553 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NefmP08553 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NefmP08553 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NefmP08553 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NefmP08553 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NefmP08553 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NefmP08553 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NefmP08553 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NefmP08553 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NefmP08553 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NefmP08553 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NefmP08553 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NefmP08553 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NefmP08553 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NefmP08553 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NefmP08553 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NefmP08553 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NefmP08553 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NefmP08553 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NefmP08553 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NefmP08553 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NefmP08553 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NefmP08553 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NefmP08553 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NefmP08553 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NefmP08553 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NefmP08553 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NefmP08553 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NefmP08553 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NefmP08553 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NefmP08553 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NefmP08553 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NefmP08553 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NefmP08553 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NefmP08553 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NefmP08553 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NefmP08553 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NefmP08553 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NefmP08553 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NefmP08553 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NefmP08553 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NefmP08553 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NefmP08553 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NefmP08553 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NefmP08553 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NefmP08553 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NefmP08553 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NefmP08553 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NefmP08553 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NefmP08553 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NefmP08553 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NefmP08553 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NefmP08553 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NefmP08553 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NefmP08553 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NefmP08553 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NefmP08553 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NefmP08553 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NefmP08553 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NefmP08553 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NefmP08553 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NefmP08553 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NefmP08553 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NefmP08553 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NefmP08553 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NefmP08553 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NefmP08553 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NefmP08553 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NefmP08553 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NefmP08553 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NefmP08553 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NefmP08553 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NefmP08553 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NefmP08553 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NefmP08553 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NefmP08553 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms