Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col3a1P08121 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms