Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtrP07309 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtrP07309 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtrP07309 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtrP07309 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtrP07309 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtrP07309 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtrP07309 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtrP07309 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtrP07309 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtrP07309 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtrP07309 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtrP07309 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TtrP07309 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtrP07309 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtrP07309 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtrP07309 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TtrP07309 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtrP07309 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TtrP07309 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TtrP07309 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TtrP07309 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TtrP07309 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TtrP07309 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TtrP07309 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TtrP07309 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TtrP07309 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TtrP07309 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TtrP07309 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TtrP07309 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TtrP07309 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TtrP07309 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TtrP07309 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TtrP07309 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TtrP07309 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TtrP07309 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TtrP07309 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TtrP07309 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TtrP07309 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TtrP07309 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TtrP07309 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TtrP07309 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TtrP07309 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TtrP07309 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TtrP07309 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TtrP07309 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TtrP07309 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TtrP07309 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TtrP07309 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TtrP07309 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TtrP07309 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TtrP07309 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TtrP07309 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TtrP07309 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TtrP07309 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TtrP07309 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TtrP07309 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TtrP07309 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TtrP07309 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TtrP07309 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TtrP07309 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TtrP07309 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TtrP07309 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TtrP07309 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TtrP07309 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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TtrP07309 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TtrP07309 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TtrP07309 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TtrP07309 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TtrP07309 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TtrP07309 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TtrP07309 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TtrP07309 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TtrP07309 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TtrP07309 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TtrP07309 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TtrP07309 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TtrP07309 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TtrP07309 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TtrP07309 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TtrP07309 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TtrP07309 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtrP07309 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtrP07309 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtrP07309 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtrP07309 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtrP07309 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtrP07309 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtrP07309 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtrP07309 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtrP07309 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtrP07309 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtrP07309 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtrP07309 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtrP07309 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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