Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms