Protein–RNA interactions for Protein: P06335

T-cell receptor gamma chain C region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06335 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06335 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06335 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06335 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06335 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06335 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06335 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06335 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06335 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06335 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06335 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06335 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06335 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P06335 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P06335 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06335 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06335 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P06335 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06335 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06335 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06335 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06335 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P06335 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06335 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06335 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06335 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06335 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06335 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06335 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P06335 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06335 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06335 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06335 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06335 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06335 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06335 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06335 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06335 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06335 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06335 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06335 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06335 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06335 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06335 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06335 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06335 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P06335 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06335 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06335 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06335 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P06335 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P06335 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06335 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06335 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06335 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06335 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06335 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06335 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06335 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06335 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06335 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06335 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06335 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06335 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P06335 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06335 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06335 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06335 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06335 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06335 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06335 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06335 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06335 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06335 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06335 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06335 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06335 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06335 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06335 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06335 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06335 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06335 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06335 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06335 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06335 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P06335 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06335 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06335 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06335 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06335 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P06335 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06335 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06335 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06335 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06335 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P06335 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06335 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06335 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P06335 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P06335 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms