Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06323 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06323 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06323 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06323 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06323 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06323 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06323 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06323 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06323 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06323 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06323 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06323 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06323 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06323 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P06323 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06323 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06323 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06323 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P06323 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P06323 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06323 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06323 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06323 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06323 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06323 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06323 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06323 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06323 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06323 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06323 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06323 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06323 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06323 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06323 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06323 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06323 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06323 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06323 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06323 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06323 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06323 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06323 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06323 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06323 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06323 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06323 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06323 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06323 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06323 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06323 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06323 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06323 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
P06323 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06323 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06323 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06323 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06323 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06323 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06323 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06323 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06323 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06323 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06323 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06323 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P06323 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06323 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06323 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06323 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06323 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06323 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06323 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06323 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P06323 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P06323 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P06323 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P06323 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P06323 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P06323 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P06323 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P06323 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P06323 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P06323 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P06323 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P06323 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06323 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06323 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06323 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06323 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06323 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06323 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06323 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P06323 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P06323 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P06323 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P06323 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06323 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06323 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06323 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06323 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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