Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P04212 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P04212 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P04212 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P04212 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P04212 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P04212 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P04212 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P04212 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P04212 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P04212 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P04212 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P04212 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P04212 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P04212 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P04212 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P04212 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P04212 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P04212 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P04212 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P04212 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P04212 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P04212 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
P04212 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04212 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04212 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04212 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04212 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04212 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04212 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04212 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04212 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04212 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04212 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04212 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04212 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04212 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04212 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04212 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04212 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P04212 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04212 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04212 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04212 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04212 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04212 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04212 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04212 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04212 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04212 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04212 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P04212 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04212 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04212 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04212 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04212 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04212 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04212 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04212 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04212 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04212 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04212 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04212 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04212 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04212 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04212 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04212 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04212 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04212 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04212 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04212 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04212 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04212 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04212 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04212 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04212 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P04212 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P04212 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04212 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04212 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04212 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04212 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04212 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04212 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04212 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04212 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04212 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P04212 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04212 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04212 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04212 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04212 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04212 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04212 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04212 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04212 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04212 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04212 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04212 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04212 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms