Protein–RNA interactions for Protein: P01804

Ig heavy chain V-III region HPC76 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01804 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01804 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01804 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01804 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01804 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01804 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01804 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01804 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01804 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01804 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01804 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01804 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01804 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01804 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01804 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01804 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01804 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01804 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01804 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01804 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01804 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01804 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01804 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01804 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01804 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01804 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01804 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01804 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01804 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01804 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01804 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01804 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01804 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01804 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01804 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01804 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01804 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01804 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01804 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01804 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01804 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01804 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01804 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01804 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01804 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01804 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01804 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01804 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01804 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01804 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01804 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01804 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01804 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01804 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01804 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01804 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01804 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01804 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01804 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01804 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01804 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01804 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01804 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01804 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01804 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01804 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01804 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01804 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01804 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01804 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01804 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01804 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01804 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01804 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01804 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01804 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01804 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01804 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01804 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01804 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01804 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01804 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01804 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01804 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01804 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01804 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01804 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01804 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01804 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01804 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01804 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01804 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01804 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01804 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01804 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01804 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01804 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01804 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01804 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01804 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms