Protein–RNA interactions for Protein: P01724

Ig lambda-1 chain V regions MOPC 104E/RPC20/J558/S104, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01724 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01724 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01724 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01724 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01724 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01724 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01724 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01724 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01724 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01724 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01724 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01724 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01724 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01724 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01724 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01724 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01724 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01724 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01724 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01724 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01724 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01724 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01724 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01724 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01724 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01724 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01724 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01724 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01724 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01724 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01724 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01724 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01724 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01724 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01724 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01724 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01724 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01724 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01724 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01724 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01724 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01724 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01724 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01724 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01724 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01724 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01724 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01724 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01724 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01724 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01724 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01724 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01724 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01724 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01724 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01724 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01724 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01724 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01724 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01724 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01724 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01724 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01724 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01724 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01724 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01724 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01724 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01724 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01724 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01724 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01724 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01724 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01724 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01724 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01724 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01724 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01724 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01724 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01724 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01724 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01724 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01724 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01724 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01724 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01724 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01724 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01724 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01724 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01724 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01724 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01724 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01724 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01724 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01724 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01724 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01724 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01724 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01724 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01724 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01724 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms