Protein–RNA interactions for Protein: P01660

Ig kappa chain V-III region PC 3741/TEPC 111, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01660 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01660 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01660 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01660 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01660 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01660 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01660 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01660 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01660 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01660 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01660 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01660 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01660 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01660 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01660 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01660 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01660 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01660 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01660 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01660 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01660 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01660 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01660 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01660 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01660 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01660 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01660 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01660 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01660 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01660 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01660 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01660 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01660 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01660 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01660 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01660 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01660 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01660 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01660 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01660 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01660 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01660 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01660 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01660 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01660 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01660 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01660 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01660 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01660 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01660 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01660 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01660 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01660 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01660 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01660 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01660 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01660 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01660 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01660 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01660 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01660 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01660 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01660 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01660 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01660 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01660 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01660 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01660 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01660 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01660 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01660 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01660 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01660 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01660 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01660 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01660 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01660 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01660 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01660 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01660 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01660 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01660 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01660 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01660 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01660 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01660 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01660 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01660 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01660 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01660 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01660 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01660 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01660 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01660 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01660 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01660 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01660 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01660 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01660 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01660 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms