Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01641 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01641 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01641 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01641 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
P01641 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01641 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01641 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01641 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01641 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01641 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
P01641 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01641 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01641 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01641 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01641 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
P01641 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01641 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01641 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01641 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01641 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01641 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01641 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01641 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01641 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01641 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01641 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01641 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01641 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01641 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01641 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01641 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01641 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01641 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01641 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01641 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01641 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01641 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01641 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01641 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01641 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01641 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01641 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01641 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01641 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01641 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01641 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01641 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01641 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01641 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01641 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01641 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01641 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
P01641 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
P01641 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01641 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01641 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01641 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01641 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01641 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01641 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
P01641 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01641 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01641 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01641 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01641 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01641 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01641 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
P01641 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01641 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01641 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01641 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01641 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01641 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01641 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01641 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01641 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01641 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01641 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01641 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01641 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01641 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01641 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01641 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01641 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01641 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01641 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01641 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01641 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01641 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01641 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01641 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01641 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01641 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01641 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01641 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01641 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01641 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01641 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01641 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134 ms