Protein–RNA interactions for Protein: P01572

Ifna1, Interferon alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna1P01572 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms