Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4bP01029 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4bP01029 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4bP01029 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4bP01029 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4bP01029 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4bP01029 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4bP01029 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C4bP01029 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4bP01029 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4bP01029 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4bP01029 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4bP01029 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4bP01029 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4bP01029 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4bP01029 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4bP01029 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4bP01029 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4bP01029 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4bP01029 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4bP01029 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4bP01029 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4bP01029 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4bP01029 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4bP01029 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4bP01029 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4bP01029 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4bP01029 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4bP01029 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4bP01029 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4bP01029 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C4bP01029 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C4bP01029 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C4bP01029 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4bP01029 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4bP01029 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4bP01029 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4bP01029 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4bP01029 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4bP01029 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C4bP01029 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4bP01029 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4bP01029 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4bP01029 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4bP01029 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4bP01029 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C4bP01029 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4bP01029 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4bP01029 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4bP01029 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4bP01029 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4bP01029 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C4bP01029 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C4bP01029 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4bP01029 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4bP01029 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4bP01029 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4bP01029 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4bP01029 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
C4bP01029 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
C4bP01029 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4bP01029 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4bP01029 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4bP01029 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4bP01029 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4bP01029 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4bP01029 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4bP01029 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4bP01029 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4bP01029 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4bP01029 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4bP01029 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4bP01029 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4bP01029 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4bP01029 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4bP01029 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4bP01029 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C4bP01029 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4bP01029 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C4bP01029 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4bP01029 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C4bP01029 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4bP01029 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4bP01029 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4bP01029 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4bP01029 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4bP01029 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4bP01029 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C4bP01029 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4bP01029 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4bP01029 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4bP01029 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4bP01029 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4bP01029 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4bP01029 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4bP01029 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4bP01029 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4bP01029 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4bP01029 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4bP01029 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms