Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Stx8O88983 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx8O88983 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx8O88983 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx8O88983 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx8O88983 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx8O88983 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx8O88983 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx8O88983 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx8O88983 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx8O88983 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stx8O88983 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx8O88983 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx8O88983 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx8O88983 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx8O88983 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx8O88983 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx8O88983 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx8O88983 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx8O88983 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx8O88983 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx8O88983 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx8O88983 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx8O88983 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx8O88983 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx8O88983 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx8O88983 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stx8O88983 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms