Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms