Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apaf1O88879 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms