Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnkO88874 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnkO88874 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnkO88874 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnkO88874 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CcnkO88874 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CcnkO88874 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CcnkO88874 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CcnkO88874 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CcnkO88874 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms