Protein–RNA interactions for Protein: O88848

Arl6, ADP-ribosylation factor-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6O88848 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arl6O88848 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl6O88848 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arl6O88848 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arl6O88848 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arl6O88848 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arl6O88848 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arl6O88848 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arl6O88848 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms