Protein–RNA interactions for Protein: O88838

Spsb2, SPRY domain-containing SOCS box protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb2O88838 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spsb2O88838 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms